El escenario es históricamente auténtico y meticuloso. Muestra una combinación de estilos arquitectónicos griego, romano y egipcio que puede ser adecuado para la época, pero el vestuario es anacrónico. Los soldados romanos portan armadura genérica y armas que se usaron más en el siglo I d.C., sin embargo, el filme se ambienta en el siglo V d.C., cuando ya no tenían armaduras de cuero, sino de escamas o cotas de malla.

Se sabe que Hipatia de Alejandría vivió entre los siglos IV y V d.C., hasta su muerte en 415, ya que tres fuentes primarias la mencionan. Ninguno de sus trabajos ha sobrevivido, pero se cree, por fuentes secundarias, que sus principales áreas de estudio y trabajo eran la geometría y la astronomía.

El astrofísico español Antonio Mampaso, asesor científico del filme, asevera que Hipatia inventó el hidrómetro, un instrumento aún usado hoy y que su padre, Teón de Alejandría, junto con ella, inventó el astrolabio. Sin embargo, el hidrómetro ya era conocido en esa época, pues se registró a Papo de Alejandría usándolo aún antes que Hipatia naciera. De igual manera, es generalmente aceptado que el astrolabio ya era conocido por los griegos antes de la era cristiana.

No hay evidencia que Hipatia haya estudiado el modelo heliocéntrico propuesto por Aristarco de Samos, o que encontrara cualquier prueba que lo respaldara.